More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3074 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 302 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  64.68 
 
 		 261 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  62.35 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  61.18 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  61.18 
 
 		 262 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  61.18 
 
 		 262 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  60.39 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  56.3 
 
 		 275 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  61.92 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  55.38 
 
 		 269 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  55.73 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  56.86 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  53.67 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  57.25 
 
 		 260 aa  255  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  57.03 
 
 		 267 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  53.91 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  55.71 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  53.12 
 
 		 272 aa  251  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  56.39 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  57.81 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  57.08 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  52.54 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  53.36 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  53.44 
 
 		 272 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  51.91 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  54.24 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  53.44 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  51.65 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  53.58 
 
 		 273 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  53.39 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  54.02 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  56.64 
 
 		 269 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  52.74 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  55.86 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  50.61 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 263 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.58 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 268 aa  195  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  47.71 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 275 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 267 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 267 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 261 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  36.29 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.7 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.46 
 
 		 272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.41 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.86 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.63 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.4 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.67 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  44.49 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  44.92 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  32.82 
 
 		 279 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 267 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  38.2 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.04 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  36.95 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 267 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.98 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  34.51 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  43.04 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  45.89 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  34.98 
 
 		 723 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  38.46 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  38.39 
 
 		 257 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 267 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>