More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2964 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 276 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  72.84 
 
 		 272 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  61.62 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  65.11 
 
 		 277 aa  292  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  58.14 
 
 		 269 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  60.54 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  61.42 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  60.62 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  64.52 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  57.31 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  64 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  54.94 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  60.41 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  56.92 
 
 		 267 aa  262  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  57.74 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  48.91 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  54.69 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  62.55 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  62.11 
 
 		 270 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  65.25 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  55.47 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  52.12 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  56.91 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  66.02 
 
 		 265 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  53.67 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  53.67 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  64.66 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  53.28 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 		 267 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  61.33 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  52.57 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  58.47 
 
 		 270 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  52.23 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  41.76 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  53.51 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  43.78 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  55.11 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.32 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.91 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  42.46 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  42.17 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40.78 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  46 
 
 		 280 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.54 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.63 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  31.75 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  32.53 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  32.93 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  42.64 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.11 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  43.02 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.6 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  32.94 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.25 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  31.43 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  32.41 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  34.21 
 
 		 268 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.01 
 
 		 700 aa  150  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  40.85 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.01 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  36.19 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.56 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  33.73 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 268 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  31.89 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>