More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1207 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  45.56 
 
 		 267 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  46.94 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  45.15 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  44.92 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  43.36 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  43.36 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  43.36 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  43.32 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.46 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  45.67 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.62 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  43.22 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 		 268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  38.13 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  38.13 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2466  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 265 aa  207  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.46 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  38.93 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40.56 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  38.49 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  41.95 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.24 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 268 aa  201  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  35.2 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.66 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  38.43 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  37.15 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1740  tryptophan synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.17 
 
 		 302 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  38.34 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.02 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  37.01 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 258 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 279 aa  194  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  35.63 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>