More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1563 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  57.79 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  49.18 
 
 		 267 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  49.18 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  48.76 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  46.49 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  46.77 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  45.42 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  45.49 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.63 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  44.31 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  46.99 
 
 		 271 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  47.23 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  47.93 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  44.87 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  45.76 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  47.33 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  48.18 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  44.96 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  46.64 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.77 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 265 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  45.61 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  45.68 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  45.17 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  43.82 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  38.87 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  43.87 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  36.98 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.53 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.01 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  45.42 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  46.75 
 
 		 270 aa  204  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.98 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  44.26 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  43.62 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  41.7 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  46.69 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  44.18 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>