More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1948 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  89.27 
 
 		 261 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  61.39 
 
 		 267 aa  308  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  56.92 
 
 		 271 aa  289  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  48.46 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  47.31 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  50.62 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  46.92 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  42.47 
 
 		 700 aa  229  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  47.31 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  45.95 
 
 		 265 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  52.07 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  45.32 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  45.83 
 
 		 671 aa  216  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  47.11 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  40.08 
 
 		 723 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  45.95 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.25 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  45.17 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  44.62 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.46 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  42.31 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  46.09 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.55 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.17 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 268 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  42.62 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 271 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  43.85 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 272 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  42.28 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  42.25 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  41.31 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  46.18 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.86 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 269 aa  194  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  44.96 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.02 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>