More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1693 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  56.23 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  59.23 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  56.92 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  47.73 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  47.52 
 
 		 671 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  46.99 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  43.78 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.92 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  46.21 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  44.18 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  44.18 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  40.38 
 
 		 723 aa  221  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  39.3 
 
 		 700 aa  217  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  43.3 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.15 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  43.72 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  40.51 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  45 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  41.2 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  40.23 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.02 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.39 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 265 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  42 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  40.6 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  44 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.8 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  39.93 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  39.85 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  43.18 
 
 		 268 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  38.91 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  43.13 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  46.12 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  42.46 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  43.16 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  42.98 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>