More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5244 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 269 aa  540  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  83.08 
 
 		 285 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  82.53 
 
 		 269 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  82.16 
 
 		 269 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  75.63 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  75.66 
 
 		 285 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  73.16 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  72.06 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  70.22 
 
 		 272 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  68.28 
 
 		 271 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  63.57 
 
 		 265 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  63.57 
 
 		 265 aa  341  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  63.2 
 
 		 265 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  67.66 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  63.2 
 
 		 265 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  61.34 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  61.71 
 
 		 265 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  57.62 
 
 		 270 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  58.96 
 
 		 271 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  56.51 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  59.33 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  62.92 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  56.88 
 
 		 270 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  54.65 
 
 		 265 aa  295  6e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  54.1 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  57.46 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  57.46 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  57.46 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  55.39 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  55.19 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  53.87 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  58.96 
 
 		 271 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  54.48 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  54.04 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  50.91 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  51.59 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  50.55 
 
 		 272 aa  265  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  57.77 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  53.85 
 
 		 266 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  48.59 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  52.94 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  51.48 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  52.87 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  52.87 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.06 
 
 		 270 aa  244  9e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  49.45 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  45.39 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 268 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 270 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  44.07 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.19 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  49.18 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  48.36 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  52.65 
 
 		 268 aa  224  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  48.33 
 
 		 273 aa  224  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  48.36 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  45.76 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.95 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 265 aa  214  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 272 aa  212  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  42.55 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  44.19 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  47.54 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  50.61 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 277 aa  208  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>