More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0077 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 270 aa  520  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  51.72 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  51.7 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  47.1 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  46.72 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  50.77 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  45.56 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  47.95 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  45.23 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  46.75 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  44.98 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  43.93 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.21 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  41.74 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.48 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  47.57 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  40.66 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  42.28 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.37 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  46.96 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  44.14 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  42.63 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 278 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.72 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  41.3 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  39.23 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  41.37 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.84 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  38.72 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  42.35 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  36.5 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  42.11 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  38.02 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  38.02 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.19 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  41.32 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  40 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 279 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  38.63 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  38.95 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  43.45 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  38.95 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.36 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>