More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3350 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  98.13 
 
 		 267 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  64.89 
 
 		 264 aa  344  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  69.47 
 
 		 267 aa  331  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  66.04 
 
 		 269 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  62.07 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  50.38 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  52.04 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  49.62 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  50.94 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  46.74 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 269 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 269 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  50.56 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  50.56 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  50.56 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  51.87 
 
 		 270 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  48.68 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  49.62 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  48.85 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  45.25 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  52.07 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  50.57 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  51.89 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  52.7 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  51.46 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  53.59 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  53.19 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  51.22 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  51.05 
 
 		 279 aa  234  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 263 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  49.18 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  54.47 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  53.16 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  50.63 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  56.62 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  50.42 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  51.44 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 265 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  41.76 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  51.63 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  51.21 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  51.22 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  46.24 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  50.62 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  49.81 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  49.15 
 
 		 278 aa  228  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  44.87 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  47.77 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  46.75 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  46.36 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  46.9 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  52.65 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  50.21 
 
 		 271 aa  224  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  46.27 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  47.39 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  46.92 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  44.94 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  50.19 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.88 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  47.39 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  52.19 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  47.68 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  46.69 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 280 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  49.58 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  48.4 
 
 		 671 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  39.85 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>