More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3238 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  78.14 
 
 		 279 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  77.78 
 
 		 279 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  77.78 
 
 		 279 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  73.65 
 
 		 281 aa  417  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  68.82 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  67.74 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  67.38 
 
 		 279 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  68.86 
 
 		 278 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  68.95 
 
 		 278 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  66.79 
 
 		 278 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  65.34 
 
 		 278 aa  361  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  64.6 
 
 		 277 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  67.77 
 
 		 275 aa  359  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  64.98 
 
 		 278 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  64.62 
 
 		 278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  64.98 
 
 		 277 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  68.61 
 
 		 281 aa  351  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 280 aa  349  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 280 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 278 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  61.65 
 
 		 279 aa  347  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  66.3 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  64.34 
 
 		 278 aa  341  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  67.87 
 
 		 282 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  63.33 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 		 267 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  59.49 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 269 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  56.62 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  55.47 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 268 aa  314  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  61.48 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  63.16 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  63.16 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  63.16 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  57.88 
 
 		 265 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  58.92 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  54.66 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  51.09 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  51.1 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  55.46 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  51.48 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  50.55 
 
 		 275 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.13 
 
 		 270 aa  224  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  47.93 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  44 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  45.04 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  50.18 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  49.41 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  46.75 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  45.2 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  41.91 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  44.77 
 
 		 271 aa  211  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  44.81 
 
 		 271 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  42.63 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  44.78 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  49.58 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  45.2 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  47.35 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  43.07 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  47.11 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 270 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  46.43 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  47.04 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>