More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4282 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  98.57 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  82.44 
 
 		 279 aa  477  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  78.14 
 
 		 279 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  77.98 
 
 		 281 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  70.97 
 
 		 279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  69.89 
 
 		 279 aa  400  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  69.53 
 
 		 279 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  68.59 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  66.79 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  66.43 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  65.7 
 
 		 278 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  66.06 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  67.15 
 
 		 278 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  62.72 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  63.74 
 
 		 278 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  65.34 
 
 		 278 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  65.2 
 
 		 280 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  64.71 
 
 		 280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  64.84 
 
 		 275 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  64.34 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  64.1 
 
 		 279 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  61.54 
 
 		 277 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  67.18 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  63.87 
 
 		 281 aa  334  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  62.31 
 
 		 267 aa  332  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 269 aa  327  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  63.97 
 
 		 282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  58.09 
 
 		 269 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  61.48 
 
 		 263 aa  318  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  57.35 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 269 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  55.88 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  55.68 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  56.62 
 
 		 269 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 269 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  61.33 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  55.85 
 
 		 265 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  58.68 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  52.19 
 
 		 265 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.13 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50.63 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  43.35 
 
 		 268 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  48.4 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  42.19 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  44.7 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  43.38 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  44.35 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  49.15 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  47.11 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  47.7 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  44.4 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  48.12 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  44.73 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  43.93 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  44.21 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  43.93 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  47.64 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  45.57 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.77 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  44.03 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  46.95 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 270 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  46.58 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  43.1 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  41.9 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>