More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2593 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  98.88 
 
 
269 aa  530  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  87.59 
 
 
285 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  82.53 
 
 
269 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  79.21 
 
 
279 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  77.94 
 
 
272 aa  427  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  74.63 
 
 
272 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  76.47 
 
 
273 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  77.9 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  66.17 
 
 
265 aa  357  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  65.43 
 
 
265 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  65.43 
 
 
265 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  69.03 
 
 
271 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  68.77 
 
 
272 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  63.94 
 
 
265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  63.57 
 
 
265 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  60.22 
 
 
270 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  62.08 
 
 
273 aa  315  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  57.99 
 
 
265 aa  311  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  56.51 
 
 
265 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  57.46 
 
 
268 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  59.33 
 
 
271 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  59.18 
 
 
272 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  57.62 
 
 
271 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  59.11 
 
 
270 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  58.21 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  61.57 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  61.42 
 
 
268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  54.91 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  58.21 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  58.21 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  58.21 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  55.93 
 
 
273 aa  281  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  53.51 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  56.67 
 
 
266 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  54.48 
 
 
279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  54.81 
 
 
271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  52.38 
 
 
268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  54.41 
 
 
267 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  50.55 
 
 
272 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  59.76 
 
 
277 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  52.57 
 
 
270 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  51.12 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  51.12 
 
 
272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 
268 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 
268 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  49.4 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.06 
 
 
270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  50.55 
 
 
274 aa  240  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  49.59 
 
 
272 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  45.19 
 
 
272 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  49.44 
 
 
264 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  44.81 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  49.19 
 
 
278 aa  235  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  53.28 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  46.13 
 
 
270 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  46.86 
 
 
269 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  46.49 
 
 
269 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  46.49 
 
 
269 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  46.49 
 
 
269 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  46.13 
 
 
268 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
261 aa  224  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  45.02 
 
 
270 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 
269 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 
269 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  45.69 
 
 
265 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 
267 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  45.49 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.94 
 
 
261 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 
265 aa  214  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  45.2 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  45.49 
 
 
277 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.56 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  47.5 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  44.81 
 
 
277 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 
272 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  44.57 
 
 
271 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  46.75 
 
 
267 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.67 
 
 
271 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 
279 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 
278 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 
269 aa  208  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 
279 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  41.45 
 
 
281 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 
279 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  46.72 
 
 
278 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>