More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3047 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  89.71 
 
 		 272 aa  497  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  78.68 
 
 		 273 aa  430  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  75.56 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  75 
 
 		 269 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  74.63 
 
 		 269 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  73.74 
 
 		 279 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  72.59 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  70.22 
 
 		 269 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  68.38 
 
 		 271 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  62.87 
 
 		 265 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  63.6 
 
 		 265 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  62.87 
 
 		 265 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  61.03 
 
 		 265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  66.18 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 265 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  57.35 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  59.93 
 
 		 273 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  57.72 
 
 		 271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  55.88 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  57.35 
 
 		 271 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  57.2 
 
 		 272 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  57.72 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  54.78 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  54.41 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  57.72 
 
 		 268 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  53.09 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  55.84 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  51.84 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  51.25 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  52.19 
 
 		 279 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  52.55 
 
 		 271 aa  268  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  51.27 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  48 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  55.6 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  46.91 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.65 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  49.45 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  49.45 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  51.46 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 272 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  46.59 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.31 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  48 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  47.98 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  47.6 
 
 		 273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  46.4 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  46.33 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 278 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  45.9 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  43.87 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  40.86 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  45.2 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  43.87 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  48.91 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  46.96 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.2 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>