More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1411 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  63.14 
 
 		 257 aa  347  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  58.04 
 
 		 256 aa  314  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  58.59 
 
 		 257 aa  314  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  50.58 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  45.8 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  43.7 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  45.53 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.75 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45.71 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 271 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  42.08 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.83 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  43.83 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  43.83 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  43.83 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  43.83 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  43.22 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  40.46 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  42.55 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  44.4 
 
 		 266 aa  208  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  40.41 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  41.34 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 280 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  46.37 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 267 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 267 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1275  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.02 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  45.75 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 268 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  41.46 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  42.17 
 
 		 271 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  41.3 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  44.18 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  42.04 
 
 		 302 aa  191  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  36.29 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  36 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  39.68 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  42.58 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  42.13 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 267 aa  185  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  40.24 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  44.25 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  38.29 
 
 		 279 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 279 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.32 
 
 		 269 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>