More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3037 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  78.21 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  70.86 
 
 		 304 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  64.89 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  61.17 
 
 		 290 aa  329  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  51.36 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  51.16 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  43.04 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  41.18 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.61 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.01 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  38.41 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.86 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.43 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.04 
 
 		 269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  39.78 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.76 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  35.2 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  38.24 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.51 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.74 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  37.87 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 268 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  41.02 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.36 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.25 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  37.68 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  40.26 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  35.55 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.55 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  40.96 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.4 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  34.12 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.94 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  40.25 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  34.38 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  35.11 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  40.66 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.04 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  37.5 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  36.51 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  40.16 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  38.08 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  37.04 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.23 
 
 		 700 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>