More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0319 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  48.13 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  44.66 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  45.75 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  41.87 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.11 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 279 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  41.41 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  43.97 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  45.11 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  38.89 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.56 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  43.36 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.46 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  38.31 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  38.67 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  43.05 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.42 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  43.11 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.84 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  38.25 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  44.14 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.67 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  40.47 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  40.86 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  44.05 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  40.86 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  40.09 
 
 		 723 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  44.05 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  42.19 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 274 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  40.89 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  37.96 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  42.24 
 
 		 700 aa  178  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  38.63 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41702  predicted protein  40.99 
 
 		 671 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  43.11 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  35.95 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  40.32 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  43.11 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  38.13 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 269 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.84 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  42.13 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.13 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  39.82 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.36 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  39.82 
 
 		 274 aa  175  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  39.38 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  39.82 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  43.17 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>