More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0327 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  92.28 
 
 
259 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  91.83 
 
 
258 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  89.96 
 
 
259 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  61.07 
 
 
250 aa  323  2e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.76 
 
 
263 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.96 
 
 
302 aa  201  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 
274 aa  199  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.24 
 
 
268 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 
274 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 
259 aa  195  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  40.91 
 
 
296 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 
272 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  37.9 
 
 
266 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.64 
 
 
269 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  40.48 
 
 
269 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 
270 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 
266 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  43.84 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
275 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  43.84 
 
 
271 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
268 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 
269 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  42.41 
 
 
268 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 
269 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 
267 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
276 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  36.54 
 
 
275 aa  185  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 
269 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  40.24 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  39.38 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  40.54 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  40.34 
 
 
258 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 
279 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 
279 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.55 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.94 
 
 
270 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 
279 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  35.97 
 
 
269 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 
279 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 
271 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 
278 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  41.1 
 
 
266 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 
279 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  38.24 
 
 
261 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.25 
 
 
269 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.65 
 
 
277 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 
265 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  35.43 
 
 
279 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 
279 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 
267 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 
264 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 
304 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  37.16 
 
 
281 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  39.21 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  35.89 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.54 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 
278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 
278 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.94 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  34.63 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.37 
 
 
265 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 
271 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.77 
 
 
278 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  41.52 
 
 
700 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 
276 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.89 
 
 
265 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  37.75 
 
 
715 aa  169  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  41.55 
 
 
269 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 
261 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 
278 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 
265 aa  168  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  35.81 
 
 
264 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  38.86 
 
 
279 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  38.86 
 
 
279 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  36 
 
 
255 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  37.77 
 
 
278 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  35.66 
 
 
267 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.12 
 
 
265 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  36.9 
 
 
273 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 
262 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  34.92 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 
281 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  37.05 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.24 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.54 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  36.48 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  35.52 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>