More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1393 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  56.76 
 
 		 265 aa  291  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  47.22 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  49.18 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.09 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  44.27 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  44.02 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.89 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  43.25 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  44.35 
 
 		 256 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  41.87 
 
 		 269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  42.17 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  39.77 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  42.69 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  40.64 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  41.87 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  41.87 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  45.98 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  43.55 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  40.65 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  42.91 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  43.42 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.49 
 
 		 302 aa  185  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 271 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  42.28 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  43.36 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  40.73 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  42.34 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  41.33 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  40.54 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  41.3 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  42.34 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.29 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  37.64 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.78 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  39.39 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  39.53 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.96 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.96 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  42 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  45.22 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  39.39 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  39.39 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 265 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.08 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>