More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0008 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  98.87 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  67.56 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  67.92 
 
 		 269 aa  361  6e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  65.79 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  59.47 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 279 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  53.03 
 
 		 266 aa  294  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  53.64 
 
 		 268 aa  285  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  52.27 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  52.27 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  52.69 
 
 		 267 aa  274  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  52.49 
 
 		 266 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  51.33 
 
 		 265 aa  268  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  50.21 
 
 		 302 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  44.62 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.83 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.77 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.31 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45.61 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.13 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.78 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.77 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.35 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  42.04 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  40.24 
 
 		 258 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  39.23 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  41.86 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 255 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.42 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.82 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  40.77 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  40.3 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  44.84 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.23 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.32 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  35.79 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  34.85 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  38.58 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  41.46 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>