More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1689 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  91.6 
 
 		 281 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  65.56 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  62.98 
 
 		 272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  58.85 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  58.85 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 262 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  56.43 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  57.31 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  59.24 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  55.04 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  55.17 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 		 266 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  54.85 
 
 		 276 aa  258  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  58.47 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  57.14 
 
 		 276 aa  248  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 289 aa  248  5e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  55 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  50.94 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  49.64 
 
 		 269 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  51.35 
 
 		 261 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  52.67 
 
 		 267 aa  244  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  52.67 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  57.74 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  52.42 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  54.63 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  52.69 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  52.23 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  50.99 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  52.02 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  54.72 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  52.33 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  49.03 
 
 		 260 aa  211  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  43.27 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  53.22 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  51.91 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.06 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.39 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 269 aa  185  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.06 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  39.53 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  35.66 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.15 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.62 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.97 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 268 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.93 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.92 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 266 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  38.11 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.49 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.35 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  34.54 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  39 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.87 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.97 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  39.08 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  38.17 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  35.94 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.07 
 
 		 700 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  40 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  35.59 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  41.98 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  37.65 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>