More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1273 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 304 aa  592  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  74.3 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  70.86 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  63.7 
 
 		 296 aa  341  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  60.41 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 263 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.21 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 268 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  37.99 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  37.77 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  33.7 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36.53 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  32.96 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  38.06 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 255 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  31 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  36.75 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.73 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  37.73 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  41.83 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.27 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  36.11 
 
 		 256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  35.56 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.55 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  38.06 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.25 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  39.24 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  35.06 
 
 		 268 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  31.7 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  32.22 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.17 
 
 		 270 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  34.27 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  40.52 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  34.32 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  38.15 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  34.18 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  39.78 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  39.84 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  36.52 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  36.71 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.11 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.7 
 
 		 700 aa  155  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.13 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 258 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.27 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  33.7 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 258 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  37.22 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>