More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003083 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  95.52 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  74.91 
 
 		 268 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  73.51 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  65.17 
 
 		 269 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  62.92 
 
 		 268 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  64.29 
 
 		 270 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  63.16 
 
 		 269 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  62.92 
 
 		 268 aa  352  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  67.42 
 
 		 272 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  66.17 
 
 		 269 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  341  9e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  66.42 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  66.29 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  64.79 
 
 		 281 aa  332  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  61.94 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  64.53 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  61.8 
 
 		 268 aa  328  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  61.42 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  61.42 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  61.42 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  61.42 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  61.42 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  61.65 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 273 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  63.4 
 
 		 278 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 273 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  64.15 
 
 		 278 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 278 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  65.79 
 
 		 266 aa  321  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  63.4 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  61.42 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  61.11 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  60.69 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  56.25 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  59.4 
 
 		 280 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  39.77 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  38.49 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  38.29 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  35.07 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.5 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  38.17 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.78 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.57 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  35.47 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.95 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  36.7 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.23 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  37.71 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  38.06 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  35.45 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.51 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.02 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  35.09 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  40.98 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.86 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  35.47 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  34.7 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.47 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.2 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  36.19 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>