More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2834 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  67.56 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  59.4 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  57.89 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  59.4 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  56.77 
 
 		 268 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  56.39 
 
 		 268 aa  308  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  56.34 
 
 		 270 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  55.85 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 268 aa  299  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  56.77 
 
 		 269 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  58.27 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  53.33 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  55.64 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  56.55 
 
 		 268 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  56.44 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  54.89 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  54.89 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  55.09 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 278 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  54.14 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  53.96 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  54.45 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  54.85 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  53.96 
 
 		 278 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  55.64 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  55.64 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  52.52 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  52.52 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  55.39 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 273 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  53.56 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  56.98 
 
 		 266 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  40.41 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  39.76 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.59 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  35.36 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  37.85 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.66 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.96 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  37.89 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.64 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  36.11 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  36.14 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  34.6 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.88 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  35.51 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.92 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  33.84 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  35.97 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.61 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  35.58 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>