More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1149 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  73.51 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  72.39 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  75.28 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  65.17 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 268 aa  358  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  69.55 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 278 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  62.92 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 278 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  70.08 
 
 		 273 aa  351  7e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  63.16 
 
 		 269 aa  351  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 272 aa  351  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 278 aa  351  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  67.55 
 
 		 267 aa  351  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  69.32 
 
 		 278 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  69.7 
 
 		 278 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  68.18 
 
 		 272 aa  347  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  63.53 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  61.8 
 
 		 268 aa  345  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  67.17 
 
 		 267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  65.54 
 
 		 281 aa  331  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  62.41 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  60.3 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  60.82 
 
 		 269 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  65.04 
 
 		 266 aa  315  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  60.74 
 
 		 271 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  56.46 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  56.87 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  56.55 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.32 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  36.98 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  39.39 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.06 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  36.36 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.91 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  37.36 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  38.8 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  36.19 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  35.07 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  37.41 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  38.28 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.14 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  35.53 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  35.82 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.06 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  34.72 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  36.64 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.98 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  33.58 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.1 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  35.16 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>