More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1601 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  99.25 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  84.7 
 
 		 268 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  85.45 
 
 		 268 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  85.07 
 
 		 268 aa  457  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  85.45 
 
 		 268 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  84.7 
 
 		 268 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  84.33 
 
 		 268 aa  454  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  81.65 
 
 		 269 aa  447  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  78.28 
 
 		 269 aa  434  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  78.73 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  75.75 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  76.69 
 
 		 269 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  78.36 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  77.99 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  77.49 
 
 		 271 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  61.05 
 
 		 268 aa  346  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  61.13 
 
 		 270 aa  345  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  59.93 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  63.77 
 
 		 269 aa  338  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  63.67 
 
 		 268 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  65.53 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 273 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  59.78 
 
 		 282 aa  328  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 278 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  63.26 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 281 aa  325  6e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 278 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  62.12 
 
 		 272 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  61.36 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  64.29 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 263 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  54.51 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  36.88 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.7 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.69 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  38.58 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.61 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  38.65 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.14 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  37.11 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.72 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 267 aa  168  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.83 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.25 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.77 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  33.09 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.43 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  38.8 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  35.85 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>