More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2727 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 271 aa  520  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  77.04 
 
 		 266 aa  391  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  71.43 
 
 		 264 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  54.61 
 
 		 270 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  57.69 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  58.94 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  56.82 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  57.72 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  55.06 
 
 		 269 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  56.06 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  57.44 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  55.09 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  56.28 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  55.37 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  55.56 
 
 		 279 aa  251  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  54.12 
 
 		 279 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  52.55 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 279 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  52.55 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  54.96 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  53.73 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  54.58 
 
 		 275 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  57.2 
 
 		 265 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  56.3 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  53.28 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  53.15 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  53.75 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  55.93 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  52.34 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  55.46 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  54.2 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  52.94 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  51.49 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  49.82 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  45.79 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  53.28 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  57.5 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  47.93 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  46.82 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 265 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  46.62 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.56 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  52.65 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  46.01 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  52.27 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  46.09 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  47.41 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  50.41 
 
 		 277 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  52.52 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  49.17 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  44.44 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 265 aa  211  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  51.14 
 
 		 285 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  56.96 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  40.22 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  44.57 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 272 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 265 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  43.75 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  55.46 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  44.19 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  46.09 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>