More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1695 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  71.27 
 
 		 278 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  72 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  70.55 
 
 		 278 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  68.61 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  68.5 
 
 		 277 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  70.18 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  69.49 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 281 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  67.27 
 
 		 278 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  66.06 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  67.64 
 
 		 278 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  69.12 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  64.96 
 
 		 279 aa  362  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  65.69 
 
 		 279 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  64.23 
 
 		 279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  64.6 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  63.87 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  66.06 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  68.36 
 
 		 275 aa  358  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  69.12 
 
 		 279 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  65.45 
 
 		 280 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  65.45 
 
 		 280 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  66.91 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  63.24 
 
 		 268 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  61.9 
 
 		 269 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  62.13 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  70.8 
 
 		 282 aa  338  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  61.9 
 
 		 269 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  62.27 
 
 		 269 aa  334  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  61.9 
 
 		 269 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  61.31 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  61.9 
 
 		 269 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  61.54 
 
 		 269 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  60.81 
 
 		 269 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  59.93 
 
 		 270 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  66.25 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  64.57 
 
 		 263 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  63.39 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  63.39 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  63.46 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  56.99 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  61.07 
 
 		 271 aa  294  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  56 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  54.47 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  54.07 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  57.26 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 264 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  54.98 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  57.5 
 
 		 271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  51.63 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  51.05 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  45.09 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  50.62 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  48.13 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  46.96 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  49.37 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  48.95 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  45.96 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  45.39 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  48.95 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  48.95 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 269 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 271 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  49.37 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  46.52 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  44.61 
 
 		 271 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  48.35 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  47.01 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 268 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 268 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 273 aa  219  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  51.68 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  51.88 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  44.07 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  41.61 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  46.64 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  47.33 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  47.04 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  47.33 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  48 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  51.68 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>