More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1063 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  73.96 
 
 		 266 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  71.43 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  52.83 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  52.45 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  52.45 
 
 		 268 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  51.66 
 
 		 279 aa  249  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  53.01 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  55.56 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  52.63 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  51.88 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  52.63 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 269 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  52.42 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  51.64 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  55.46 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  53.91 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 277 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  53.91 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  51.53 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  52.29 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  52.67 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  49.42 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  49.82 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  50.18 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  52.46 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  51.57 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  53.05 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  51.23 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  51.23 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  49.08 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  52.14 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  47.64 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  46.76 
 
 		 278 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  47.64 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  50.64 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  50.64 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  49.61 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  47.1 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  49.08 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  45.99 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  49.2 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  47.99 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  43.19 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  48.32 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  49.18 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.69 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  51.13 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.67 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  44.63 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  44.02 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  43.27 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  49.8 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  42.31 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  51.69 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.56 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  45.49 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  43.56 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  40.24 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  46.01 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  45.63 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  44.32 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  44.31 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  45.8 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  42.25 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  42.52 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 267 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  48.39 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  45.06 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  46.22 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  43.73 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  43.45 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 		 269 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 275 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.91 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>