More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1329 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 276 aa  528  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 278 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  53.65 
 
 		 279 aa  280  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  56.16 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  52.92 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  55.11 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  53.07 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  54.74 
 
 		 269 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  51.81 
 
 		 279 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  52.38 
 
 		 270 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  54.38 
 
 		 269 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  61.17 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  55.07 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  53.65 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  51.09 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  53.26 
 
 		 278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  52.92 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  52.75 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  56.67 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  52.75 
 
 		 268 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  57.72 
 
 		 271 aa  265  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  52.38 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  55.47 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  53.45 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  53.45 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  54.28 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  56.41 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  52.19 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  53.08 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  54.73 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  47.27 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  51.64 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  46.74 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 279 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  53.69 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  53.69 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  53.69 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  49.28 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  49.43 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  50.42 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  54.24 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  44.8 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  51.48 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  49.1 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  49.1 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  50.63 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  49.37 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  47.7 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  40.73 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  49 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  45.83 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  45.99 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  48.35 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  41.48 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.7 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  48.35 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  45.99 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  45.31 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  46.25 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  42.53 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 278 aa  218  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  47.48 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  46.09 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  47.11 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  46.06 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  48.84 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  47.92 
 
 		 268 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 271 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  48.33 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  44.84 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  47.77 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>