More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2068 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  56.82 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  58.62 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  52.96 
 
 		 271 aa  281  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  53.79 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  58.33 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  54.92 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  59.84 
 
 		 266 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  56.91 
 
 		 276 aa  271  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  51.76 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  53.01 
 
 		 268 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  55.82 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  56.06 
 
 		 265 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  52.8 
 
 		 272 aa  261  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  55.83 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  53.38 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  53.31 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  56.07 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  55 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  51.14 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  56.44 
 
 		 271 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  53.94 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  55.68 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  56.63 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  51.12 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  51.12 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  57.38 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  52.87 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  51.12 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  53.96 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  48.09 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  49.63 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  48.88 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  46.99 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  53.57 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  46.06 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  49.8 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  46.62 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  51.46 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  45.56 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  45.72 
 
 		 269 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  45.52 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  43.91 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  53.59 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  48.55 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  44.89 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  46.49 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  44.32 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  46.21 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  49.37 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  49.37 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  46.47 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  50.83 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  44.05 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  45.93 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>