More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4620 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
271 aa  530  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  93.36 
 
 
271 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  93.33 
 
 
272 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  92.62 
 
 
271 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3568  tryptophan synthase subunit alpha  93.36 
 
 
271 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4407  tryptophan synthase subunit alpha  93.36 
 
 
271 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3960  tryptophan synthase subunit alpha  93.36 
 
 
271 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0955296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  84.87 
 
 
270 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  83.33 
 
 
271 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  83.39 
 
 
270 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  85.56 
 
 
271 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0767  tryptophan synthase subunit alpha  85.56 
 
 
271 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  85.93 
 
 
271 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  85.56 
 
 
271 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  85.56 
 
 
271 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  85.56 
 
 
271 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  85.56 
 
 
271 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0681  tryptophan synthase subunit alpha  83.7 
 
 
271 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  73.48 
 
 
265 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  70.83 
 
 
265 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  71.21 
 
 
265 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  71.21 
 
 
265 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  74.24 
 
 
265 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  69.89 
 
 
271 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 
265 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  62.12 
 
 
265 aa  331  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  64.58 
 
 
272 aa  324  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  59.93 
 
 
272 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 
273 aa  316  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  57.52 
 
 
268 aa  315  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  59.33 
 
 
269 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
273 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1911  tryptophan synthase subunit alpha  57.2 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  61.28 
 
 
285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  62.12 
 
 
268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  61.19 
 
 
269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  58.67 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  57.99 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  59.4 
 
 
285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  56.47 
 
 
279 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  56.77 
 
 
266 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  53.7 
 
 
271 aa  284  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  54.51 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  55.26 
 
 
271 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  55.93 
 
 
270 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  55.56 
 
 
274 aa  278  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  51.85 
 
 
270 aa  277  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  56.02 
 
 
277 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  51.29 
 
 
272 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  51.31 
 
 
268 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  55 
 
 
272 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  55 
 
 
272 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 
268 aa  258  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 
268 aa  258  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  47.6 
 
 
275 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 
272 aa  249  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  54.34 
 
 
264 aa  248  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 
278 aa  247  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  49.06 
 
 
267 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  50.57 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.94 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  45.69 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  55.3 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  45.32 
 
 
272 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  48.85 
 
 
269 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.57 
 
 
269 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.19 
 
 
269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  54.04 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  48.85 
 
 
267 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  48.85 
 
 
270 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2841  tryptophan synthase subunit alpha  54.89 
 
 
269 aa  234  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.19 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  45.59 
 
 
272 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  47.31 
 
 
268 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
277 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  47.19 
 
 
277 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 
270 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  47.31 
 
 
268 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  46.38 
 
 
278 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  45.29 
 
 
278 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  49.24 
 
 
265 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  45.65 
 
 
278 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  47.41 
 
 
271 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 
263 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  47.93 
 
 
278 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  44.57 
 
 
269 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  47.11 
 
 
278 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 
278 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 
271 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  45.77 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  50.57 
 
 
267 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  47.35 
 
 
279 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  44.73 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  46.53 
 
 
263 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 
267 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  47.46 
 
 
279 aa  214  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  47.01 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>