More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4745 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  77.95 
 
 		 267 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  77.95 
 
 		 267 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  72.35 
 
 		 265 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  72.14 
 
 		 268 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  67.68 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  68.82 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  64.12 
 
 		 274 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 266 aa  329  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  62.15 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  51.72 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  53.58 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 280 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  48.09 
 
 		 280 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  50.57 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 290 aa  250  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  50.94 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  46.18 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  49.61 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.24 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  45.86 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.57 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  43.51 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  46.48 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  43.27 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  46.62 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.94 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  43.82 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.97 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  45.12 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  46.54 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  41.06 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.77 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  45.97 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  45.97 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  42.21 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  43.23 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  43.49 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  44.9 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  42.21 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  46.95 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  47.93 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.23 
 
 		 265 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  44.4 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  45 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  44.4 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  43.89 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  41.44 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  40.6 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.3 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  42.91 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  40.15 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  46.22 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  43.03 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  42.53 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>