More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4174 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 
285 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  97 
 
 
285 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  95.09 
 
 
285 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  78.71 
 
 
280 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  53.59 
 
 
267 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  52.74 
 
 
267 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 
262 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  46.56 
 
 
267 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 
264 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  45.68 
 
 
279 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  52.65 
 
 
271 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  47.3 
 
 
272 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  45.63 
 
 
269 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  47.35 
 
 
265 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  46.77 
 
 
266 aa  222  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  47.89 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 
267 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 
267 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  47.72 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  47.72 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  45.35 
 
 
267 aa  215  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  45.35 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  47.06 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  44.24 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  44.65 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  45.93 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.22 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  49.19 
 
 
266 aa  212  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  47.93 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.08 
 
 
267 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  44.7 
 
 
269 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  43.87 
 
 
279 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  40.89 
 
 
256 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  46.89 
 
 
263 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  46.43 
 
 
279 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  43.12 
 
 
281 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.42 
 
 
267 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 
266 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 
255 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 
270 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  49.06 
 
 
271 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  40.86 
 
 
258 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.02 
 
 
275 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 
255 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  38.02 
 
 
257 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  48.77 
 
 
265 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 
280 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  41.79 
 
 
279 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  45.68 
 
 
268 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  41.43 
 
 
258 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 
271 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 
258 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.22 
 
 
261 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 
265 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 
269 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  45.42 
 
 
268 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  45.68 
 
 
269 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 
267 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  43.89 
 
 
267 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 
279 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
269 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.53 
 
 
266 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 
279 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  46.27 
 
 
280 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  39.69 
 
 
258 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 
259 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  45.53 
 
 
271 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 
258 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  46.27 
 
 
280 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 
258 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  35.88 
 
 
280 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  43.6 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  46.01 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  43.73 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  43.55 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  46.15 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  41.43 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.38 
 
 
255 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  41.83 
 
 
279 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  43.87 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  45.9 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  43.77 
 
 
266 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41.8 
 
 
272 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 
278 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 
269 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 
274 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 
272 aa  198  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  42.21 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  35.36 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  43.97 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  41.1 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>