More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2273 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  65.65 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  64.93 
 
 		 268 aa  363  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  66.54 
 
 		 265 aa  358  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  62.98 
 
 		 267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  64.12 
 
 		 266 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  58.96 
 
 		 266 aa  329  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  54.83 
 
 		 302 aa  298  6e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  49.24 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  46.95 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  46.82 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 266 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  44.11 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  48.3 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  50.41 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  44.32 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  45.25 
 
 		 262 aa  234  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  43.13 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  45.34 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  43.3 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  42.75 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  40.56 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  40.55 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  41.86 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  40 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.38 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  41.98 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  40.96 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.35 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  41.9 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  45.45 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  41.11 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  38.64 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  43.07 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  39.11 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  42.7 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 277 aa  191  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.85 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  41.57 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  36.7 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  40.98 
 
 		 285 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  39.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  40.66 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  40.22 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  39.32 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  42.08 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  43.38 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>