More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1657 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  96.5 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  96.11 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  91.83 
 
 		 259 aa  486  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  59.84 
 
 		 250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  43.95 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  39.76 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  37.94 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.71 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.48 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 276 aa  185  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.71 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  40.54 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 269 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 280 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.65 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.15 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.68 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  39.08 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 268 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  36.4 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.66 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  41.02 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  37.77 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 279 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  36.54 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.72 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 279 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  38.87 
 
 		 700 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06290  tryptophan synthase, putative  37.6 
 
 		 715 aa  170  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  35.89 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.12 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  35.32 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  35.91 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.48 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  33.46 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  39.08 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  38.33 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  35.41 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  34.51 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  35.86 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  35.66 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  35.96 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>