More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1452 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 263 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  80.99 
 
 		 264 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  71.21 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  61.22 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  59.7 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  57.79 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  62.41 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 266 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  60.84 
 
 		 267 aa  294  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  63.4 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  62.9 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  56.87 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  63.88 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  60.7 
 
 		 272 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 262 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 262 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 262 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  62.41 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  62.78 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  55.13 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  55.13 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  59.4 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  60.54 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  57.03 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  52.09 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  57.02 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  53.88 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  53.68 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  55.87 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  61.22 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  52.85 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  54.15 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  57.59 
 
 		 269 aa  228  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  52.32 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  47.83 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  47.54 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  39.76 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 268 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.31 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.29 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  39.51 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.25 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.76 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  41.89 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  40 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1094  tryptophan synthase, alpha subunit  43.58 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  43.3 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  44.06 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  43.73 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  42.39 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  38.8 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  37.4 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.97 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.76 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  43.3 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.36 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  37.12 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40.83 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4867  tryptophan synthase subunit alpha  36.56 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.97 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  39.46 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  32.93 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.67 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  37.59 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>