More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0411 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 266 aa  524  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  67.56 
 
 		 268 aa  346  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  66.16 
 
 		 266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 267 aa  341  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 267 aa  341  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  61.98 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  58.96 
 
 		 274 aa  329  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 266 aa  329  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  61.89 
 
 		 265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  56.82 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  53.61 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  53.26 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  53.03 
 
 		 271 aa  294  9e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  57.37 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 275 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 269 aa  288  6e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  56.82 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  50 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  47.1 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  48.66 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  47.73 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  46.21 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  46.24 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.35 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  49.39 
 
 		 267 aa  224  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  50 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  46.44 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  46.77 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  44.66 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  46.39 
 
 		 285 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.13 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  46.77 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.68 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  44.4 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.89 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.19 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  38.76 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  47.95 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  49.1 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  45.22 
 
 		 280 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.5 
 
 		 279 aa  198  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  45 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  42.26 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  45.49 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  44.15 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  43.77 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  44.3 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  37.55 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  41.13 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  43.46 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  47.2 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.49 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 269 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1587  tryptophan synthase subunit alpha  42.39 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>