More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1684 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
281 aa  554  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  91.6 
 
 
272 aa  454  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  66.54 
 
 
268 aa  337  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  64.26 
 
 
272 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  55.19 
 
 
275 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  58.75 
 
 
262 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  58.75 
 
 
262 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  58.75 
 
 
262 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  57.59 
 
 
262 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  58.37 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  58.82 
 
 
261 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  55.6 
 
 
274 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  56.03 
 
 
277 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  53.88 
 
 
263 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  56.49 
 
 
266 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  55.47 
 
 
276 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  47.84 
 
 
289 aa  257  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  58.47 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  57.74 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  52.12 
 
 
261 aa  252  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  56.42 
 
 
270 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  54.2 
 
 
267 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  54.2 
 
 
267 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  51.94 
 
 
269 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  50.19 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  52.79 
 
 
274 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  55.51 
 
 
302 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  55.81 
 
 
269 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  53.31 
 
 
267 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  52.23 
 
 
264 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  52.71 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  50.79 
 
 
270 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  52.02 
 
 
272 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  54.33 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  49.42 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  52.34 
 
 
273 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  51.93 
 
 
292 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.45 
 
 
256 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.44 
 
 
266 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 
278 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  41.77 
 
 
266 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.22 
 
 
280 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.84 
 
 
272 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  33.71 
 
 
275 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.71 
 
 
279 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.16 
 
 
255 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 
263 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 
261 aa  178  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  40.16 
 
 
267 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 
268 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.53 
 
 
302 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.16 
 
 
274 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  33.08 
 
 
280 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  34.07 
 
 
279 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.13 
 
 
269 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  39.84 
 
 
261 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  36.44 
 
 
262 aa  176  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.37 
 
 
265 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.66 
 
 
262 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  38.91 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.3 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.3 
 
 
264 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 
250 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 
259 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  35.25 
 
 
267 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 
290 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  39.16 
 
 
263 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.5 
 
 
260 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  35.08 
 
 
271 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  35.2 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 
259 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 
265 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 
259 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  34.8 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  34.92 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  35.83 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.9 
 
 
723 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  34.41 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.06 
 
 
258 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.29 
 
 
700 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  37.4 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  38.17 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  39.85 
 
 
296 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  36.97 
 
 
258 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  37.96 
 
 
285 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  36.72 
 
 
257 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.6 
 
 
267 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  39.08 
 
 
285 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0354  tryptophan synthase subunit alpha  38.57 
 
 
249 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  37.95 
 
 
257 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  35.74 
 
 
269 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  40.96 
 
 
290 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 
267 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 
271 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>