More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3173 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  74.44 
 
 		 270 aa  358  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  64.91 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  63.4 
 
 		 263 aa  329  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  60.36 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  62.26 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  59.69 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  61.34 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  57.36 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  61.24 
 
 		 266 aa  295  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  63.71 
 
 		 276 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  60.47 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  60 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  57.14 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  56.02 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  58.05 
 
 		 278 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  56.18 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  56.47 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  56.18 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  55.08 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  56.18 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  54.98 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  48 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  55.93 
 
 		 277 aa  254  9e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  61.13 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  55.08 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  52.92 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  56.03 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  55.64 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.53 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  51.56 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  56.87 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  51.32 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  54.43 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  45.63 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  41.83 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.4 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  39.84 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.42 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.19 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  38.24 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  33.71 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  41.39 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.48 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  36.94 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.23 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.18 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  37.72 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  42.51 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  40.46 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  36.19 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  38.13 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  43.49 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.48 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 268 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.95 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  40.66 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.24 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  39.03 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  40.46 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  42.08 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>