More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1166 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  74.44 
 
 		 272 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  64.15 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  61.11 
 
 		 269 aa  319  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  62.41 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  59.11 
 
 		 272 aa  291  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  60 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  60.15 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  62.35 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  56.39 
 
 		 261 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  57.65 
 
 		 262 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  57.65 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  57.65 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  60.78 
 
 		 278 aa  278  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  59.39 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  61.87 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 267 aa  275  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  57.56 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  53.76 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  54.75 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  55.29 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  58.05 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  60.53 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  54.2 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  57.38 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  56.86 
 
 		 270 aa  258  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  51.48 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  62.41 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  59.54 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50.95 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  51.57 
 
 		 281 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  51.19 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  55.94 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  54.14 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  48.25 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  54.27 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.85 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.19 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41.25 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40.44 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.76 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.76 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  42.39 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  41.11 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  41.56 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  36.96 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  37.36 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  44.3 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  39.63 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  41.31 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  40.22 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.11 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  43.62 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 264 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  41.11 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.48 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.11 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 272 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  39.53 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  37.87 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  42.92 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  41.41 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.59 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>