More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 		 272 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  72.56 
 
 		 278 aa  337  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  60.89 
 
 		 274 aa  327  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  66.67 
 
 		 276 aa  318  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  69.77 
 
 		 269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  65.95 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  72.84 
 
 		 276 aa  294  8e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 262 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  61.6 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  61.6 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  62.72 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  62 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  63.18 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  60.7 
 
 		 263 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  62.95 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  55.17 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  60.42 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  62.83 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  57.2 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  55.56 
 
 		 269 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  59.25 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  66.38 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  59.38 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  58.11 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  62.98 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  62.35 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  59.05 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  58.54 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  56.89 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  64.47 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  59.11 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  57.14 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  54.14 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  67.36 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  55.89 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  57.26 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  46.26 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.3 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.2 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 267 aa  185  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.7 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  43.93 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.25 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 261 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.31 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40.68 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  41.05 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.97 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 269 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.11 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.08 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 268 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.78 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  36.99 
 
 		 723 aa  168  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  39.75 
 
 		 700 aa  168  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  38.43 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.24 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  37.8 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  43.93 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  44.35 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  44.35 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.82 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>