More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2511 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 266 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  66.3 
 
 		 273 aa  354  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  66.02 
 
 		 267 aa  329  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  67.19 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  62.65 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  64.47 
 
 		 274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  61.57 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  62.31 
 
 		 261 aa  307  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  61.18 
 
 		 262 aa  307  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  60.62 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  60.62 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  66.15 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  60.77 
 
 		 270 aa  295  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  66.38 
 
 		 272 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  63.01 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  62.66 
 
 		 277 aa  288  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  64.59 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  54.2 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  56.49 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  60.62 
 
 		 276 aa  275  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  60.8 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  60.53 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  59.78 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  55.6 
 
 		 272 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  52.31 
 
 		 289 aa  261  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  62.35 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  55.69 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  51.79 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  62.99 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  60.8 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  53.68 
 
 		 292 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.38 
 
 		 279 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  42.15 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  43.51 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  42.91 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.22 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  40.94 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  36.07 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.1 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  40.86 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.31 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  38.52 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  35.97 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  36.9 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  42.44 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  37.76 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  36.33 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 285 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.69 
 
 		 723 aa  168  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.5 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  38.63 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  38.93 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  37.72 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.28 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.28 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  32.56 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.02 
 
 		 700 aa  164  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  39.15 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40.26 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  39.23 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  38.72 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  34.75 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>