More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1839 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 263 aa  526  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  72.16 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  55.23 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.87 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.78 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  46.35 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  46.47 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  44.96 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  36.44 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  44.58 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  45.23 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  40.61 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  41.3 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  46.36 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 278 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 268 aa  184  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  43.88 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  42.56 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  44.06 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45.22 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  40.69 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  44.35 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  43.63 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  45.61 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  40.96 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.98 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  42 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  49.12 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 254 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 269 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  46.22 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.64 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  45.76 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  42.54 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.87 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  38 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  37.87 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  39.61 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  47.16 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  42.61 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  43.35 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.98 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 263 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  43.23 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  37.21 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  36.03 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  36.6 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.25 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  43.7 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  41.8 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>