More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3065 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  99.62 
 
 		 262 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  99.62 
 
 		 262 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  84.73 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  84.35 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  81.99 
 
 		 270 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  68.36 
 
 		 275 aa  352  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  65.76 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  58.91 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 267 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  60.75 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  63.71 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  57.95 
 
 		 269 aa  294  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  63.25 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  62.75 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  63.18 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  61.04 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  61.66 
 
 		 278 aa  284  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 263 aa  284  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  58.37 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  58.69 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  60.53 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 289 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  59.7 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  62.36 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  57.41 
 
 		 276 aa  255  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  61.83 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  56.2 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  53.41 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  54.24 
 
 		 273 aa  241  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  57.65 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  55.65 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  53.28 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  59.11 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.64 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  44.58 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  38.72 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.85 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  39.52 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.29 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.1 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  41.34 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.53 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  45.04 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  43.9 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  36.5 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 268 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.96 
 
 		 700 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.67 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  40.74 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  35.42 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  37.04 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  37.84 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  41.02 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  36.84 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  38.8 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  42.62 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.75 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  40 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  33.46 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  40.86 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>