More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  65.5 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  59.77 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  62.02 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  60.47 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  58.91 
 
 		 262 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  58.91 
 
 		 262 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  58.91 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  65.09 
 
 		 302 aa  301  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  62.11 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  60.62 
 
 		 266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  52.43 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  58.05 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  58.37 
 
 		 260 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  58.05 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  55.13 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  57.2 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  55.47 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  55.68 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  54.27 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  57.14 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  57.41 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  54.77 
 
 		 277 aa  255  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  54.85 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  52.12 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  59.77 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  56.54 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  51.35 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  54.69 
 
 		 276 aa  245  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  54.44 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  52.03 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  55.51 
 
 		 269 aa  238  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  51.48 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  52.08 
 
 		 292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  45.95 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  45.95 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  44.59 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.15 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.8 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.64 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  46.69 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  41.98 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.98 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  43.75 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  42.21 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.72 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  38.52 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  37.64 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  41.84 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  42.04 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  42.5 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  36.78 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  42.08 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.98 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  38.27 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.41 
 
 		 279 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  39.83 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  39.03 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  43.57 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  42.25 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  36.8 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>