More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1075 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  57.95 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  57.52 
 
 		 273 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  61.19 
 
 		 274 aa  292  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 266 aa  291  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  56.92 
 
 		 275 aa  288  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 262 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  57.03 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  59.13 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  58.33 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  58.24 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  55.51 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  62.55 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  59.35 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  58.14 
 
 		 270 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  59.77 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  60.89 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  57.45 
 
 		 274 aa  264  8.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  54.14 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  58.55 
 
 		 302 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  58.37 
 
 		 273 aa  254  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  58.47 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  54.23 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  55.6 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  61.6 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  53.7 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 289 aa  241  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  55.17 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  53.08 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  53.73 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  56.15 
 
 		 269 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  51.41 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  53.6 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.77 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  46.22 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  42.69 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  43.41 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.86 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.38 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.61 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  39.1 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 268 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  40.42 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.92 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.55 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.98 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  37.3 
 
 		 700 aa  168  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  35.51 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.13 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  35.98 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  34.48 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  35.96 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  42.06 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  39.24 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  39.77 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  39.84 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  35.02 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  37.17 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  37.86 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  35.69 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  38.75 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  36.98 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  37.08 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>