More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0109 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  59.69 
 
 
263 aa  333  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  54.77 
 
 
267 aa  266  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  51.36 
 
 
276 aa  265  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  51.01 
 
 
290 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  49.06 
 
 
304 aa  257  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 
279 aa  257  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  50.79 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  46.72 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 
274 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  42.8 
 
 
302 aa  222  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  45.15 
 
 
268 aa  218  7e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  43.08 
 
 
268 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  45.74 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  46.03 
 
 
269 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  43.08 
 
 
266 aa  214  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  44.66 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  41.57 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 
255 aa  211  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 
264 aa  211  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  44.8 
 
 
269 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  43.24 
 
 
267 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  46.05 
 
 
265 aa  209  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  44.21 
 
 
265 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  43.27 
 
 
279 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  44.84 
 
 
269 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  40.38 
 
 
280 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  44.23 
 
 
272 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  40.78 
 
 
266 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  45.93 
 
 
255 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  44.26 
 
 
271 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  42.52 
 
 
268 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 
269 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  40.78 
 
 
271 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  42.39 
 
 
280 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  42.52 
 
 
268 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  46.81 
 
 
267 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  45.96 
 
 
259 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  44.44 
 
 
269 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  43.15 
 
 
279 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  43.6 
 
 
270 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  43.98 
 
 
270 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 
278 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 
275 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  44.31 
 
 
256 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  44.54 
 
 
260 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  44.17 
 
 
279 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  44.94 
 
 
257 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  41.31 
 
 
267 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  43.55 
 
 
278 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  41.74 
 
 
265 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 
278 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  41.9 
 
 
278 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  43.09 
 
 
259 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  42.4 
 
 
279 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  41 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  44.81 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  43.15 
 
 
279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  42.37 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  44.8 
 
 
256 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 
269 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  40.3 
 
 
269 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  40.7 
 
 
261 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 
265 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  41.38 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 
259 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 
263 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 
263 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 
259 aa  195  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  40.77 
 
 
285 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  40.77 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  43.46 
 
 
273 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 
279 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.03 
 
 
267 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  43.2 
 
 
272 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  43.03 
 
 
274 aa  193  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 
263 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 
261 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  41.67 
 
 
279 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.08 
 
 
269 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  41.11 
 
 
279 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 
280 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  45.12 
 
 
264 aa  191  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 
250 aa  191  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  44.3 
 
 
258 aa  191  9e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  41.43 
 
 
275 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 
280 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  43.33 
 
 
278 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  40 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  38.35 
 
 
276 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
278 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>