More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0214 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  52.85 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  52.42 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  44.02 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  47.33 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.37 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 267 aa  208  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  45.78 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.4 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  43.73 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  40.84 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  47.46 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  42.8 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  44.89 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  46.72 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  36.54 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.11 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  44.35 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  41.44 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  41.44 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  41.06 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  47.33 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  39.7 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  36.54 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  38.98 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  39.45 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  39.54 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  42.32 
 
 		 268 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  39.92 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  39.41 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  36.05 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  38.37 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  41.83 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  40.23 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.91 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  38.55 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  40.23 
 
 		 260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  46.09 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  39.02 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  44.07 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  43.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  42 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  43.25 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  41.2 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  42 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  41.41 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>