More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1791 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  49.03 
 
 
265 aa  248  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  47.22 
 
 
274 aa  239  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  44.02 
 
 
275 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  45.98 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.63 
 
 
267 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  45.96 
 
 
259 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  45.23 
 
 
270 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  39.02 
 
 
268 aa  203  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  41.86 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.49 
 
 
265 aa  197  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  41.5 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  44.59 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  41.67 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  41.6 
 
 
266 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.46 
 
 
272 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  45.78 
 
 
271 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  44.16 
 
 
271 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  40.15 
 
 
268 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  43.46 
 
 
266 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  42.62 
 
 
250 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  41.22 
 
 
257 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 
268 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  44.63 
 
 
264 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  40.46 
 
 
266 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  41.15 
 
 
256 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  40.84 
 
 
262 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  41.31 
 
 
258 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  45.5 
 
 
278 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  37.26 
 
 
268 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  42.98 
 
 
302 aa  189  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  47.09 
 
 
296 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.07 
 
 
258 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  42.19 
 
 
260 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 
270 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  37.26 
 
 
269 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 
265 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  37.26 
 
 
268 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.5 
 
 
256 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  38.49 
 
 
268 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  44.39 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  46.29 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  38.08 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  37.64 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 
281 aa  182  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  39.57 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  39.36 
 
 
267 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1308  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 
267 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  41.91 
 
 
268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1255  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 
267 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00504507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0854  tryptophan synthase, alpha subunit  45.29 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  40.91 
 
 
263 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  40.08 
 
 
266 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  40.83 
 
 
271 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  43.24 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 
258 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  41.81 
 
 
269 aa  178  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.54 
 
 
267 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  38.55 
 
 
267 aa  178  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  38.49 
 
 
258 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 
267 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 
263 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 
258 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
258 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 
267 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  37.84 
 
 
258 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  40.41 
 
 
280 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
268 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  39.16 
 
 
269 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.08 
 
 
268 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 
253 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
258 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 
269 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 
279 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 
265 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
258 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  39.47 
 
 
266 aa  175  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 
258 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  39.3 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  42.42 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  38.33 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  38.11 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  40.66 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  39.08 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  36.88 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0807887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>