More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2241 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5128  tryptophan synthase, alpha subunit  50.2 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0338  tryptophan synthase subunit alpha  51.19 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.291967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2818  tryptophan synthase, alpha subunit  38.65 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  42.26 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  37.82 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1661  tryptophan synthase, alpha subunit  36.58 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.342631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.89 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.65 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  37.14 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  35.95 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  33.74 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  36.8 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3190  tryptophan synthase, alpha subunit  36.72 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  37.61 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  38.66 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  38.59 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0125  tryptophan synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  34.41 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  34.41 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  34.41 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2556  tryptophan synthase, alpha subunit  36.14 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  35.44 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  32.44 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  32.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  32.4 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  36.97 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  33.76 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  39.37 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  33.18 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  34.71 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  37.21 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  34.3 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  35.42 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  34.3 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  34.3 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  33.47 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  35 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  36.61 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0398  tryptophan synthase subunit alpha  31.14 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  34.71 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  35.54 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36.24 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  38.31 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3306  tryptophan synthase, alpha subunit  31.76 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.333024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  31.2 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  35.17 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0373  tryptophan synthase subunit alpha  31.14 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  38.89 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  33.6 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  36.13 
 
 		 272 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  35.83 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  34.75 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  34.7 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  35.65 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  40.27 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  33.2 
 
 		 268 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.26 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  34.53 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  34.38 
 
 		 302 aa  154  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0362  tryptophan synthase  34.45 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  35.87 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  35.87 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1610  tryptophan synthase subunit alpha  32.11 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1687  tryptophan synthase subunit alpha  35.94 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.894193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  35.81 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  35.17 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  35.27 
 
 		 700 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  32.39 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  32.81 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  36.49 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  37.74 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  32.49 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  32.23 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0973  tryptophan synthase subunit alpha  34.1 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0144713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0370  tryptophan synthase, alpha subunit  38.43 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  38.26 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  35.27 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>